GAZİ ÜNİVERSİTESİ BİLGİ PAKETİ - 2019 AKADEMİK YILI

DERS TANIMI
MOLEKÜLER MODELLEME TEKNİKLERİ/FKİ-6060
Dersin Adı: MOLEKÜLER MODELLEME TEKNİKLERİ
Dersin Kredisi: 2 Ders AKTS : 5
Dersin Yarıyılı: 1 Dersin Türü : Zorunlu
DERS BİLGİLERİ
 -- DERS KATALOG TANIMI (İÇERİĞİ)
 -- TEMEL DERS KİTABI
 -- YARDIMCI DERS KİTAPLARI
 -- DERSİN ÖNKOŞULLARI
 -- DERSİN DİLİ
  Türkçe
 -- DERSİN AMACI ve HEDEFİ
 -- DERSİN ÖĞRENİM ÇIKTILARI
İlaç tasarımı ve geliştirmesi sürecinde kullanılan moleküler modelleme teknikleri hakkında bilgi sahibi olur.
Temel moleküler modelleme tekniklerini uygulama ve değerlendirme becerisine sahip olur.
İlaç tasarımı ve geliştirilmesinde moleküler modelleme çalışmalarının önemini kavrar.

 -- DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİ
  Bu ders sadece yüz yüze eğitim şeklinde yürütülmektedir.
 --DERSİN HAFTALIK DAĞILIMI
1. Hafta  Moleküler modelleme yöntemlerine giriş
2. Hafta  Moleküllerin üç boyutlu görüntülenmesi, potansiyel enerji hesaplamaları
3. Hafta  X-ray veri tabanları, pdb dosyalarının genel tanımı, güvenilirliği
4. Hafta  Amino asitlerin yapısal özellikleri, protein yapısında aktif bölge analizi
5. Hafta  Ligand ve reseptör temelli moleküler modelleme çalışmaları: genel bilgi ve örnekleri
6. Hafta  Homoloji modelleme
7. Hafta  Ara sınav
8. Hafta  Moleküler docking çalışmaları
9. Hafta  Moleküler docking çalışması sonuçlarının değerlendirilmesi
10. Hafta  Fragman temelli ilaç tasarımı ve başarı örnekleri
11. Hafta  Farmakofor analizi ve farmakofor haritasının çıkartılması
12. Hafta  Sanal tarama protokolü ve başarı örnekleri
13. Hafta  Moleküler dinamik çalışmaları
14. Hafta  İki ve üç boyutlu kantitatif yapı-ilişkisi çalışmaları: genel bilgi ve uygulama örnekleri
15. Hafta  ComFA ve ComSIA modelleri
16. Hafta  Final sınavı
 -- ÖĞRETİM FAALİYETLERİ
 -- DEĞERLENDİRME ÖLÇÜTLERİ
 
Sayısı
Toplam Katkısı(%)
 Ara Sınav
1
60
 Ödev
1
10
 Uygulama
1
30
 Projeler
0
0
 Pratik
0
0
 Quiz
0
0
 Dönemiçi Çalışmaların Yıliçi Başarıya Oranı (%)  
50
 Finalin Başarıya Oranı (%)  
50
 -- DERSİN İŞ YÜKÜ
 Etkinlik  Toplam hafta sayısı  Süre (Haftalık Saat)  Dönem boyu toplam iş yükü
 Haftalık teorik ders saati
14
2
28
 Haftalık uygulamalı ders saati
0
0
0
 Okuma Faaliyetleri
6
3
18
 İnternette tarama, kütüphane çalışması
5
3
15
 Materyal tasarlama, uygulama
0
0
0
 Rapor hazırlama
3
5
15
 Sunu hazırlama
2
3
6
 Sunum
1
2
2
 Ara sınav ve ara sınava hazırlık
2
5
10
 Final sınavı ve final sınavına hazırlık
3
7
21
 Diğer
0
 TOPLAM İŞ YÜKÜ: 
115
 TOPLAM İŞ YÜKÜ / 25 : 
4.6
 DERSİN AKTS KREDİSİ: 
5
 -- PROGRAM ÖĞRENME ÇIKTILARI KATKI DÜZEYLERİ
NO
 PROGRAM ÖĞRENME ÇIKTILARI
1
2
3
4
5
1
Farmasötik Kimya alanındaki yeni bilgileri sistematik bir yaklaşımla değerlendirerek yorumlar.X
2
Farmasötik Kimya alanında, ilişkili olduğu disiplinler arası etkileşimi gözden geçirir ve bilgileri bütünleştirip yeni bilgiler oluşturmak için tartışır.X
3
Uzmanlık alanı ile ilgili mesleki gelişmeleri takip eder, meslek hayatında uygulama becerisi kazanır, program sonucunda kazanmış olduğu bilgi ve becerileri toplum yararına kullanır.X
4
Farmasötik Kimya alanında özgün bir konuyu araştırarak yeni bir çalışma tasarlar.X
5
Yaratıcı ve eleştirel düşünme, sorun çözme ve karar verme gibi üst düzey zihinsel süreçleri kullanarak alanı ile ilgili yeni düşünce ve yöntemler geliştirir.X
6
Yapacağı araştırma ile ilgili ulusal, uluslararası kaynaklardan bilgiye ulaşır, derleyip yorumlar.X
7
Yaptığı bilimsel araştırmalardan sonuç çıkartır ve raporlandırır.X
8
Akademik çalışmalarını ulusal/uluslararası bilimsel toplantılarda sunar ve alanı ile ilgili bilimsel bir makaleyi ulusal/uluslararası hakemli dergilerde yayımlar.X
9
Deneysel araştırmaları sırasında gerekli olan bilgisayar dahil laboratuvar ekipmanlarını kullanır.X
10
Etik ilkelerin ve etik kuralların birey ve toplum için önemini bilir, etik davranır.X
11
İleri organik kimya bilgisi ile kimyasal sentez prosedürlerini uygular.
12
Ayırma ve saflaştırma yöntemleri kullanarak deney yapar.
13
Spektral yapı analizleri kullanarak molekül yapılarını aydınlatır.
14
İlacın biyolojik sistemlerdeki davranışlarını değerlendirerek ilaç tasarımı için yeni kimyasal molekül önerir.X
15
İlaçların kalitatif ve kantitatif analiz yöntemleri hakkında bilgi sahibi olur ve uygular.X
16
İleri organik kimya, ilacın biyolojik sistemlerdeki davranışları, ilaçların kalitatif-kantitatif ve spektral yapı analiz yöntemleri, ayırma ve saflaştırma yöntemlerini bilir.X
 -- ÖĞRETİM ELEMAN(LAR)I
   (Doç. Dr. Gökçen EREN)
 -- ÖĞRETİM ELEMANI WEB SİTESİ/SİTELERİ
   (https://abs.gazi.edu.tr/gokcene)
 -- ÖĞRETİM ELEMANI E-POSTASI/E-POSTALARI
   (gokcene@gazi.edu.tr)